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因为朱由检知道，马士英很擅长这样的手段，在原本历史上，他一个凤阳总督就因此拉拢江北四镇力压东林党，一举掌控南明朝政大权。
如马士英真那样做，朱由检不介意阵斩主帅，为此朱由检特地允诺马士英与李岩俱可密奏，以此达到既有统合又有分制的目的。
马士英知道朱由检担心什么，只能连连请朱由检放心，毕竟他也知道自己此去西南最大的政治机会是建立军功，而不是拉拢自己的势力，因为他现在再怎么拉拢势力也不可能威慑如今的朱由检。
朱由检现在也只能把西南的战事全权交给马士英，包括云南、四川、贵州、湖广、广西、广东六省的军政大事都交给马士英，而他则才好集中精力准备对付满清还有朝廷内部的暗流汹涌。
锦衣卫都指挥同知李若琏被朱由检派做了全权负责西南战事的情报事务，由他向马士英负责，分担锦衣卫都指挥使吴孟明的压力。
而吴孟明也只负责针对满清与南方郑氏的情报事务，东厂则继续负责纠察国内的不安定因素。