这不是最近的一条路线，但是最稳妥的一条，因为这是闵悉熟悉的航路。而且一路上有很多的岛屿，至少到爪哇岛这一段，在这个时期，已经有了中国人活动的痕迹，上岸补给也会比较方便。
走这条路线的话，老修斯给的航海图用途也很大，当年麦哲伦船队虽然完美绕过了大洋洲，但他们抵达吕宋岛后，也差不多是穿过苏禄海、苏拉威西海、望加锡海峡与爪哇海折返回欧洲的。
闵悉的航海线路正是结合自己的经验和老修斯的航海图一起规划的。
船绕过台湾岛南部，并没有靠岸补给，而是直接南下，准备去吕宋补给。此时已是初夏，海上的风向已经转成了东南风，对他们这种南下的船只来说不太有利，尤其是船队中还有十几艘未经改造的福船，速度就快不起来。
为了照顾这些福船，盖伦船和战列舰也都放慢了速度，将这些福船围在中间。
闵悉和云霁虽然没有去过吕宋岛，但同行的商船基本都跟西班牙人打过交道，很多人都来过吕宋做生意，知道在哪儿补给最合适。
他们选择的第一个补给点是吕宋最大的港口城市马尼拉，这是后来菲律宾的首都，此时也是西班牙殖民当局的首府所在。
由于是逆行，又带着福船，速度快不起来，原本计划八天的航程，最后多出了两天，不过好在临行前准备充足，船上还没到缺水断粮的地步。
只是第一次做远洋航行的水师将士们适应不了长时间不能上岸的生活，大家都苦不堪言。等到了马尼拉的时候，大家都松了口气，迫不及待想要上岸去缓解一下焦躁不安的情绪。
闵悉并没有打算避开西班牙人的视线，而是大摇大摆地率领船队驶入了马尼拉，他们的船队规模庞大，就算是吕宋现在是西班牙人做主，他们也不敢对这支船队做什么。
马尼拉有大量从两广和福建过来的华人移民，有的已经在这里生活了几百年，早就在当地形成了华人聚居区，因此来这里补给是最合适的。不仅可以进行补给，还可以打听到最所需的一切信息。
他们的船队在进入港口前，便挂上了大明的旗号，毕竟他们名义上还是大明朝廷派遣的使团船。
由于规模庞大，进入港口的时候，引起了当地的轰动。当地的华人个个精神振奋、奔走相告。驻守在马尼拉的西班牙人则如临大敌，他们本来干的就是鸠占鹊巢的事，因为吕宋原本是大明的藩属国，如今他们做了吕宋的主人。不仅如此，他们还把原本聚居在马尼拉城中的华人驱逐到了城外，甚至还霸占了不少华人的产业。