三藩之乱是清朝初期三个藩镇王发起的反清事件。三藩是指平西王吴三桂、平南王尚可喜、靖南王耿精忠。
清廷入关后为对付李自成农民军和南明政府的反抗，封云南的吴三桂、广东的尚可喜、福建的耿精忠为藩王。1673年（康熙十二年）春，康熙皇帝作出撤藩的决定。吴三桂首先于这年11月杀云南巡抚朱国治，自称天下都招讨兵马大元帅，提出“兴明讨虏”，将矛头指向朝廷。吴三桂军由云、贵而开进湖南，几乎占据湖南全省。进而占据四川，四川官员纷纷投降。福建、广东、广西、陕西、湖北、河南还有台湾的明郑等地都有汉官、汉兵和少数民族上层人士，一些地区的农民、奴仆都迅速响应。
此后，吴三桂在湖南沿江布置防御工事，不再向北发展，康熙帝抓住机会调整战略、安排兵力。他首先坚决打击吴三桂，而对其他的反叛者却实行招抚，通过分化力量而孤立吴三桂。军事上仅以湖南为进攻的重点，同时能够充分信任汉将，这样就鼓舞了朝廷军队的士气。
在耿精忠、尚之信归顺清廷之后，吴三桂于1678年（康熙十七年）在衡州称帝，立国号周，建元昭武，大封诸将。其实这时的吴三桂已到了穷途末路。他积郁而死后，将所谓的“帝位”传给孙子吴世璠。1681年（康熙二十年）冬，清军进入云南省城昆明，吴世璠自杀，历时8年的三藩之乱被平定。对于清廷来说，是确立稳定的皇朝统治的标志。
平定三藩之乱后，将台湾纳入版图又被提上日程。恰逢康熙二十年（1681年），郑成功之子郑经去世，台湾内部发生政变，年仅十二岁的郑克塽继任延平王位，大权实际上为冯锡范、刘国轩掌握。郑氏官员向心力开始动摇，负责与清朝谈和的傅为霖甚至愿当内应。[35]福建总督姚启圣认为是进攻台湾的好时机，向康熙帝推荐施琅。
康熙定台图
康熙二十二年（1683年），康熙以施琅为福建水师提督，出兵攻台，在澎湖大败刘国轩所率领的郑氏海军，随后明郑纳土归降。康熙二十三年（1684年），清政府在台湾设一府（台湾府）三县，即台湾县（今台南）、凤山县（今高雄）、诸罗县（今嘉义），隶福建省，并在台湾设巡道一员，总兵官一员，副将二员，兵八千。在澎湖设副将一员，兵二千。从而加强了中央对台湾的管辖，促进了台湾经济文化的发展。
清军入关后，沙俄远征军曾多次入侵中国黑龙江流域，烧杀抢劫，四处蚕食中国领土。康熙